Protein–RNA interactions for Protein: C9J798

RASA4B, Ras GTPase-activating protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4BC9J798 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASA4BC9J798 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms