Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DXG7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DXG7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DXG7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DXG7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DXG7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DXG7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DXG7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DXG7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DXG7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DXG7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DXG7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DXG7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DXG7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DXG7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DXG7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DXG7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DXG7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DXG7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DXG7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DXG7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms