Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMTNL1A8MU46 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMTNL1A8MU46 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms