Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC169A6NNP5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC169A6NNP5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms