Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC160A6NGH7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC160A6NGH7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms