Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1LA6NFU8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1LA6NFU8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms