Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBFOX3A6NFN3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms