Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
KLHL33A6NCF5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms