Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms