Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37CA5D8V6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms