Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POTEFA5A3E0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POTEFA5A3E0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms