Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms