Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms