Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQF3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms