Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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