Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N2

TRBV20-1, T-cell receptor beta variable 20-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1A0A075B6N2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TRBV20-1A0A075B6N2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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TRBV20-1A0A075B6N2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV20-1A0A075B6N2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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