Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 AC036108.1-201ENST00000559468 588 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LINC01444-202ENST00000581211 654 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 SUZ12P1-207ENST00000583950 741 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC006557.4-201ENST00000585516 830 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC005616.1-201ENST00000592931 579 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 HMGN2P46-208ENST00000598619 490 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.71-201ENST00000612122 282 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AL109804.1-201ENST00000620777 562 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 RFPL3S-206ENST00000621921 433 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CU639417.5-201ENST00000623983 476 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ZNF132-203ENST00000639285 1200 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ADGRF1-202ENST00000371243 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ZSCAN5B-201ENST00000358992 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 PTPN20-216ENST00000506080 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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PTGFRP43088 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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PTGFRP43088 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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PTGFRP43088 TTF1-201ENST00000334270 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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PTGFRP43088 AC016582.1-201ENST00000592640 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 NR1I3-205ENST00000367983 1473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 UGT2B28-202ENST00000511240 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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