Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms