Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms