Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5A7

NUB1, NEDD8 ultimate buster 1, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUB1Q9Y5A7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUB1Q9Y5A7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUB1Q9Y5A7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms