Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAD54L2Q9Y4B4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms