Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KNSTRNQ9Y448 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms