Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC9Q9Y397 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC9Q9Y397 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC9Q9Y397 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC9Q9Y397 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC9Q9Y397 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC9Q9Y397 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC9Q9Y397 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC9Q9Y397 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC9Q9Y397 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms