Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC11AQ9Y240 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC11AQ9Y240 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms