Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVW-1Q9UQF0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms