Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms