Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP18Q9UMW8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP18Q9UMW8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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