Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms