Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
MED23Q9ULK4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED23Q9ULK4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED23Q9ULK4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED23Q9ULK4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms