Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF608Q9ULD9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms