Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms