Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP8AP2Q9UKL3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms