Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
CHIC2Q9UKJ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms