Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBE1Q9UJT0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms