Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATPIF1Q9UII2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms