Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms