Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MED13Q9UHV7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED13Q9UHV7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms