Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD4

CIDEB, Cell death activator CIDE-B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEBQ9UHD4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CIDEBQ9UHD4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms