Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SS18L2Q9UHA2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SS18L2Q9UHA2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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