Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGXB4Q9UGU5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGXB4Q9UGU5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms