Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DKK3Q9UBP4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DKK3Q9UBP4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms