Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGC1AQ9UBK2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms