Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNQ9P2M7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNQ9P2M7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms