Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT2Q9NZN8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT2Q9NZN8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms