Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP1Q9NZI2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms