Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms