Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNK4Q9NYG8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms