Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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