Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MS4A12Q9NXJ0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms