Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM106BQ9NUM4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM106BQ9NUM4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms